Prosiguen las aventuras y los extraños sucesos en torno a Kimihiro Watanuki, quien aún continúa pagando a la misteriosa, caprichosa y poderosa bruja Yuuko Ichihara para que su deseo de dejar de ver a espíritus y seres paranormales se haga realidad. Pero sus encuentros con diversos entes, seres y personas marcarán el principio de un cambio de vital importancia que Watanuki deberá atesorar con vistas al futuro. Los vínculos con la alegre Himawari Kunogi y, sobre todo, con el serio Shizuka Doumeki, se estrecharán cada vez más, y las preguntas acerca de su propia existencia se irán haciendo cada vez más frecuentes...

Soichiro Nari y Bob Makihara, dos jóvenes estudiantes, han dominado con sus puños los diferentes colegios por los que han pasado. Al llegar a la Todo Gakuen, su meta es nuevamente la misma. Pero en esta ocasión la situación no será tan fácil.
La escuela Todo Gakuen posee una larga historia, y fue fundada para convertirse en un centro de protección y desarrollo de las artes marciales. Los diferentes clubes existentes poseen fuertes guerreros, aunque todos se ven sometidos a las órdenes del Consejo de Estudiantes, presidido por Mitsuomi Takayanagi, que es posiblemente el luchador más fuerte de todo el colegio.Aún así, existe un club que no sigue sus directrices, el club Jyuuken, que tiene como capitana a Maya Natsume. Desafortunadamente para nuestro protagonista Soichiro, en uno de sus primeros combates para convertirse en dueño del colegio, Maya se enfrentará a él y le derrotará. Entonces Soichiro, deseando ser más fuerte, se unirá junto a Bob al club Jyuuken.
¿Logrará hacerse más fuerte? ¿Resistirá el club Jyuuken el acoso del Consejo de Estudiantes?

Light Yagami es un excelente estudiante japonés que ha tenido una vida aburrida. Esto cambia radicalmente cuando encuentra tirado en el suelo un misterioso cuaderno en cuya portada se lee DEATH NOTE (Cuaderno de la muerte) en el cual, al escribir el nombre de una persona, ésta muere.
Light se mantiene escéptico hasta probar la eficacia del Death Note en dos ocasiones. Pasados algunos días lo visita Ryuk, un Shinigami, que le explica sobre la existencia de dicha especie y de las Death Notes,
Entonces, Light decidirá usarlo para limpiar al mundo de la maldad.

Después de morir arrollados en las vías del metro, Korono Kei y Kato Masaku aparecen en una extraña habitación en la que se encuentran otras personas que también han tenido algún tipo de accidente mortal. Este grupo esta compuesto por un profesor de primaria, dos yakuzas, un político, otros dos jóvenes y una chica que intento suicidarse.

El único mobiliario de la habitación es una esfera negra la cual, al estar todos presentes, les proporciona trajes especiales, armamento de alto nivel tecnológico, y acto seguido les da la orden de buscar y cazar a distintos tipos de alienígenas.

Para volver a sus vidas normales deben sobrevivir y conseguir suficientes “puntos”.

La historia de Kanokon gira entorno de Kouta Oyamada, un estudiante de primer año de instituto que se traslada al Instituto Kunpo. Durante su primer dia en su nueva escuela, una hermosa estudiante de segundo año llamada Chizuru Minamoto le pide juntarse con ella en el salon de musica. Cuando el llega, ella la revela que es una deidad de zorro y desde ese dia los dos andan juntos. Nozomu es una estudiante de primer año en la el instituto Kunpo , ella es de hecho una deidad de lobo la cual esta enamorada de Kouta. Como rival de Chizuru luchara por el amor de Kouta.

Minato es un alumno repetido normal que de repente se ve inmerso en la batalla entre serkireis, unos seres con unos poderes sobre humanos, que sellan contratos con personas genéticamente predispuestas fortaleciendo sus habilidades y volviéndose todavia mas fuertes. Minato tendrá que reclutar a Sekireis mientras batalla con el resto de ashikabis y Sekireis.

Nogizaka Haruka es una chica inteligente, atractiva, rica, de muy buen carácter y que trae de cabeza a todo el instituto. Sin embargo, oculta un terrible secreto. Este secreto lo descubrirá Ayase Yuuto, cuando Haruka vaya a sacar prestada una revista de la biblioteca. El secreto es... que es una otaku. Y claro, esto no puede permitir Haruka que lo conozca la escuela, o toda su popularidad se esfumará. Yuuto promete guardar secreto, convirtiéndose en su amigo, ante las envidias de todo el instituto. Sin embargo, ¿durará esta situación mucho tiempo?

"Love Hina"" cuenta la historia de Keitarō Urashima, un chico de veinte años que quiere entrar en la prestigiosa Universidad de Tokio (o ""Tōdai"", como la llaman los japoneses, de Tōkyō Daigaku) porque cuando niños, y hace quince años desde el inicio de la historia, le hizo una promesa a su novia de la infancia de que, cuando fueran mayores, irían a la Tōdai y serían felices para siempre.

Sin embargo, Keitarō ha suspendido dos veces el examen de acceso y sus padres le echan de casa. Él decide ir a la posada de su abuela a vivir allí un tiempo y estudiar, pero hacía años que dejó de ser una posada para ser una residencia femenina con cinco inquilinas, todas hermosas y adolescentes. Al principio las chicas se lo toman muy mal, y creen que Keitarô es un pervertido, pero al final logra quedarse a vivir en la residencia como encargado, teniendo que aprender a convivir día a día con todas las chicas, las cuales poseen personalidades muy distintas entre sí, y lidiar con problemas sentimentales, domésticos y varias situaciones cómicas.